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新冠病毒属于SARS病毒?您可能误解了

尹哥聊基因 尹哥聊基因 2021-03-03

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据央视新闻消息,2月9日,湖北省召开第19场疫情防控工作新闻发布会,介绍湖北省新冠肺炎疫情防控科研攻关工作的进展情况。华中农业大学项目组表示,新型冠状病毒属于SARS冠状病毒。

于是网友们炸了,评论区一片质疑。

我很尊重李文亮医生,但一码归一码。华中农大做的这个工作很扎实数据也详实。但不能说新冠病毒属于SARS病毒。

下面是专业版分析,不想看的可直接略过哈。

专业版

2月3日,国际顶尖学术期刊 Nature 杂志同日上线两篇关于新型冠状病毒的研究论文。

石正丽团队文章从12月12日(第一位住院患者时间),从五名患者中获得了病毒全长基因组序列,这些病毒彼此几乎相同,并且对SARS冠状病毒有79.5%的基因组序列相似性。

新型冠状病毒(2019-nCoV)在全基因组水平上与蝙蝠冠状病毒具有96%的相似性。七个保守的非结构蛋白的成对蛋白序列分析表明,该病毒与SARSr-CoV非常相近。从危重病人的支气管肺泡灌洗液中分离出2019-nCoV病毒,新冠病毒进入细胞的路径与SARS一致,另外病患抗体,有中和病毒的潜力。从分子水平发现2019-nCoV 与SARS-CoV使用相同受体ACE2进入细胞。中间宿主未知。

张永振团队发表的内容结论佐证了石正丽团队的结果。张教授团队按4个基因分别建了4个树,新冠病毒有1个是在SARS那个分支的最外支,3个是和另外2个SARS-like病毒一起在外支。除了拓扑关系,系统发育树的枝长体现分歧度,枝长越短分歧度越小,越相似。从系统发育树上看SARS病毒和大部分已知的SARS-like病毒的枝长都很短,但新冠病毒与SARS病毒间的枝长则明显长一些。

总结,从系统发育树上在已测序的冠状病毒里,新冠病毒与SARS病毒最近,但其与SARS病毒间的相似性比目前已研究的不同株的SARS病毒间的相似性要低

我们仔细阅读全文发现,这一结论来源于石正丽团队的文中提到“The pairwise protein sequence analysis of seven conserved non-structural proteins show that this virus belongs to the species of SARSr-CoV”。同时我们借用文中进化树发现这一结论并不严谨,冠状病毒科下面四大属(一说亚科),冠状病毒和新冠病毒同属于贝塔属的两个种,相当于关系很近的堂兄弟。具体看下图所示。 

物种分类按林奈老爷子那一套是分门纲目科属种,新冠病毒和SARS病毒同属于冠状病毒科下面的β属,但他们演化上还是分开了,不是一个种。就好比,我们家里养的宠物猫,是属于猫科猫属下的家猫,那丛林猫,野猫这些也是猫科猫属下的物种,但我们不能说野猫属于家猫,只能说野猫属于猫科动物,因为野猫和家猫,他们在很久很久以前就分开各自去演化了,在基因组上形成了各自的特色,有各自的生存行为模式,虽然他们有很多相似之处,但不是同一个种

为帮助理解,用天龙八部经典人物理理三种冠状病毒关系哈。呃,再看不懂,尹哥也技穷了……

图示版

说人话
根据病毒之间的“血缘关系”(基因组相似性),新冠病毒只能说是和SARS病毒关系较近的堂兄弟,不能说他们就是一个人哈。

注: 最新,陈教授马上发表言论,承认自己是口误,少了“相关”俩字,本来应该是“新型冠状病毒属于 SARS 相关冠状病毒”。并指出,该结论是基于中科院武汉病毒所石正丽研究员的工作得出的。石正丽也回复,“是口误,是陈院士的口误,应该是SARS相关冠状病毒,这是病毒种的名称。”(点击查看:新冠病毒属于SARS?石正丽回复:“是陈院士的口误”

瑕不掩瑜,说清楚就好。

老院士团队都在一线,非常辛苦,做学问的态度值得我辈学习。

参考资料:1. Zheng-Li Shi. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature (2020).2. Fan Wu. et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature (2020).

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